Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
IKBKEQ14164 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms