Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL4A6Q14031 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms