Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms