Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms