Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRPF4BQ13523 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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