Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SRSF5Q13243 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms