Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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