Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms