Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms