Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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