Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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