Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP2B3Q16720 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP2B3Q16720 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms