Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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