Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZFHX3Q15911 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms