Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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