Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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