Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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