Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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