Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms