Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H2Q13888 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms