Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATRQ13535 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATRQ13535 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATRQ13535 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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