Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
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MKRN4PQ13434 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
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MKRN4PQ13434 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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MKRN4PQ13434 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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