Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms