Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms