Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PRDM2Q13029 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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