Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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GRIK2Q13002 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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GRIK2Q13002 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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