Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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