Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP1Q9Y3L3 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP1Q9Y3L3 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP1Q9Y3L3 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP1Q9Y3L3 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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