Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FSCN1Q16658 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms