Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms