Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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