Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TWIST1Q15672 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms