Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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NCAPHQ15003 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NCAPHQ15003 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NCAPHQ15003 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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