Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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