Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RFTN1Q14699 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms