Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms