Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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MKRN3Q13064 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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