Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF1Q12946 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF1Q12946 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF1Q12946 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF1Q12946 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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