Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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