Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TNP2Q05952 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms