Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPN12Q05209 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms