Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms