Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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