Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATMINO43313 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms