Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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TRIM35Q9UPQ4 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TRIM35Q9UPQ4 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TRIM35Q9UPQ4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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