Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms