Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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