Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL19A1Q14993 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms