Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PICALMQ13492 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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