Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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